第5集：陈山向张离坦露身份 周海潮监听李伯钧
荒木惟把陈夏带到了重庆，为了让陈山确认陈夏的安全，还让陈夏和陈山通了电话，陈夏对荒木惟十分信任，开心地和陈山说着话，没说几句话，荒木惟就拿过电话，让人带陈夏走了。陈山试图通过电话里的线索找到陈夏被软禁的地方，但是陈山一个人的力量太单薄了，就算他找到陈夏，在荒木惟的势力下，也不可能安全逃脱。
陈山在看完抗日话剧后，突然意识到，他身为中国人，却受制于日本人成为日本间谍，陈山的心情久久不能平复。张离来和组织上的人接头，和对方说出了自己对陈山的怀疑，组织上的人让张离先按兵不动，暗中观察陈山。张离心中忐忑不安，她担心陈山的真实身份会对组织不利。张离正在想着心事，街上突然拉起了防空警报。
几架战机从天上飞过，开始向地面投掷炸弹，张离被拥挤的人群撞到在地，正在绝望时，陈山突然出现，抱起张离在炮火中穿越人群逃跑。炮火凶猛，陈山和张离狼狈不堪，在这样的境遇下，陈山依旧对张离不离不弃，不肯丢下她。
不知过了多久，张离在医院的病床上醒来，看见坐在一旁的陈山，张离质问陈山到底是谁，陈山对张离说出了自己的真实身份，把日本人逼迫自己来到重庆假扮肖正国的事情一五一十地告诉了张离。陈山正努力说服着让张离相信自己时，余小晚担心地来看张离的情况。
晚上，李伯钧正和周海潮的手下喝酒聊天，李伯钧聊起肖正国，自己和肖正国是出生入死的好兄弟，但是最近却十分古怪，自己当初在南京保卫战的时候，手臂受过伤，但肖正国回来的那天，却猛地被他拍了一下，自己和肖正国聊到往事，肖正国也总是岔开话题，李伯钧这些话，都被周海潮监听到了。
李伯钧收到上海飓风队成员刘成给自己寄来的东西，打开一看，是一封信和怀表，正在看信时，周海潮的手下进来了，李伯钧赶紧遮掩住怀表。刘成告诉李伯钧，在上海剧院向肖正国开枪的是军统内部成员，原来周海潮当时向肖正国开枪后，不慎将怀表遗落，被刘成捡到了，于是把怀表寄给了李伯钧，希望他能查明真相。
周海潮的手下将这件事汇报给周海潮，周海潮意识到那块怀表就是自己的，吩咐手下盯住李伯钧的一举一动，自己则监听起李伯钧的电话。李伯钧给陈山打电话，提出晚上要和陈山说一些要紧的事情，陈山推辞不掉，只好答应了。
陈山给张离送饭时，聊起张离和余小晚的交情。陈山和张离说起当年陈夏病危的时候，自己给陈夏做饭吃，听着陈山富有感情的描述，张离不知道该说些什么好，安慰陈山他是一个好哥哥。陈山告诉张离，今晚李伯钧约了自己见面，陈山担心自己被李伯钧看出破绽，他恳请张离，如果自己出了事，希望张离可以替自己回到上海给自己的父亲报信。
陈山回到家里等待李伯钧，李伯钧喝了口茶，正想拿出怀表给陈山看，李伯钧却找不到怀表，他焦急地站起身来，却突然口吐白沫地倒在了地上。李伯钧不幸身亡，陈山意识到是有人要害自己，正在疑惑时，周海潮突然出现，要带陈山回军统局里调查审问。
第6集：周海潮雇凶杀人 张离为陈山寻找证人
医生在太平间检查出李伯钧的尸体上有一个针孔，并检查出毒物。关永山、费正鹏和周海潮开始审问陈山，周海潮拿出李伯钧和洪京军谈话时的录音。陈山向周海潮质问录音从何而来，周海潮却十分坦然地说洪京军的任务本来就是安装窃听器，而窃听器在使用之前要进行测试，这就录下了和李伯钧的对话。陈山和周海潮争吵起来，关永山一拍桌子，制止了两人继续吵下去，并要求陈山在事情查清楚之前，不得离开第二处。
荒木惟得知陈山出事后，没有打算搭救陈山，他认为如果陈山连周海潮都搞不定，那陈山对于他也没有什么利用价值了。周海潮又来给关永山送古董，想贿赂关永山，让关永山给自己一个科长的职位。关永山却让周海潮不要着急，要耐心地等待机会，周海潮也不好再说什么。
张离的接头人调查清楚陈山的身份后，指示张离在保证自身安全的情况下拉拢陈山。齐云和陈龙来到余小晚家里查案，余小晚有些担心陈山，齐云和陈龙告诉余小晚是周海潮在陷害陈山，余小晚则相信周海潮没这个本事。余小晚心里还是有些担心陈山，来给陈山送衣物时碰上了从医院赶来的张离，两人来找费正鹏，余小晚想为陈山作证，但费正鹏却不让余小晚和陈山见面，张离提出替余小晚去看望陈山，费正鹏思索一番，便同意了。
张离告诉陈山，如果找不到杀死李伯钧的凶手，戴局长肯定也不会放过陈山。陈山怀疑李伯钧是在来找自己的路上遇害的。张离让陈山回忆一下见到李伯钧时他有什么异常，陈山回忆起，李伯钧平常都会带着一条灰色围巾，而那天李伯钧来找自己时，外面明明风很大，李伯钧却没有戴围巾。两人都意识到这条围巾就是关键的物证。张离决定帮助陈山洗脱罪名。
周海潮和自己雇佣的杀手见面，杀手只拿到了怀表，没有拿到信，周海潮对杀手十分不满意，并让杀手在张离之前找到李伯钧的围巾，毁灭证据。周海潮和洪京军则开始寻找那封信的下楼。洪京军来到李伯钧宿舍找信的时候，张离正好到来，洪京军慌不择路，跳窗逃跑了。
余小晚回家后，发现门口摆了一束玫瑰花，余小晚有些疑惑，怀疑这束花和李伯钧的死有关系。张离让余小晚先不要着急，自己先去问问陈山知不知道花的事情。陈山回忆起，李伯钧在来找自己时，身上沾有花粉。张离决定顺着这个线索追查下去。张离在街上四处寻找卖花女，得知李伯钧向卖花女小凤买了一大束花，还把自己的围巾也送给了小凤。
第二天，如果张离没有在十点前找到证人，戴局长就要亲自审问陈山。余小晚有些担心，费正鹏让余小晚做好心理准备，现在也只有指望张离能在十点前能够把证人带回来。费正鹏希望余小晚可以去探探周海潮的口风。周海潮正准备把陈山带去白公馆见戴局长时，余小晚则来找周海潮。周海潮告诉余小晚，陈山根本不是真正的肖正国，他相信余小晚心里也有怀疑，周海潮正在质问余小晚肖正国的胎记长在哪里，余小晚回答不出，正在僵持时，关永山开始催促周海潮送陈山去白公馆。
张离和齐云陈龙找到小凤的住处，小凤却被杀手掳走，几人赶紧追上去。张离和杀手对峙，想让杀手说出幕后指使人，杀手想要逃跑，却被陈龙击毙了，张离救下小凤。另一边，陈山即将被押送去白公馆，余小晚突然出现胡搅蛮缠，为张离争取时间。张离拦下了押送陈山的车，张离带着小凤和陈山回到了第二处。小凤说出了自己和李伯钧相遇的事情，周海潮打断小凤，认为小凤的证词根本不能证明什么。
第7集：陈山洗脱杀人罪名 余小晚对陈山生好感
关永山让小凤继续往下说，小凤便说那天晚上自己跟着李伯钧回到了余小晚的家里。张离向众人分析，李伯钧在去余小晚家里之前就把围巾给了小凤，如果李伯钧的围巾上留有毒液，那么就能证明李伯钧是在到余小晚家里之前中的毒，从而就能证明陈山的清白。
周海潮自然不能让陈山这么容易地脱罪，他质疑小凤的证词，小凤却说李伯钧给自己围巾时，有许多人都看到了。张离也继续向关永山和费正鹏叙述自己在找到小凤时，和凶手起了冲突，凶手已经被击毙，周海潮正在心里暗喜凶手已经死了，便死无对证。小凤却说自己当晚见到了凶手，凶手撞了一下李伯钧，李伯钧当时就捂了一下自己的脖子。人证物证俱在，周海潮还想继续辩解下去时，就被关永山制止，要求先检查围巾上是否有残留的乌头碱毒液。
关永山正和费正鹏商量着是否要继续追查下去，费正鹏主张结案，这时化验报告也送到关永山手里，关永山见证据确凿，也同意结案。关永山决定把周海潮平调到中共科，继续当副科长，以免陈山和周海潮两人天天内斗。
余小晚来找周海潮兴师问罪，在办公室里大骂周海潮，众人在周海潮办公室门口见周海潮被骂得哑口无言，觉得十分解气。余小晚一反常态地对陈山十分热情，亲热地拉着陈山走出了第二处。陈山心里又庆幸又担忧，他庆幸自己在军统有了张离这个可以依赖的人，又担忧自己的身份被余小晚识破后，余小晚会有什么反应。他忍不住去想李伯钧那天晚上究竟要告诉自己什么事情。
周海潮原本对关永山自己的调任十分不满，关永山对周海潮一番敲打，并叮嘱他收敛锋芒，以免被陈山抓到把柄。虽然余小晚和陈山还是分房睡，但是余小晚对陈山渐渐有了好感，不再那么排斥陈山的存在，半夜里还偷偷地看陈山睡觉的样子。第二天，余小晚和张离聊起陈山，说起自己似乎已经喜欢上了陈山，张离知道陈山不是真正的肖正国，有些担心，也不好附和余小晚。
荒木惟又一次给陈山给出暗号，陈山接到荒木惟的电话，荒木惟要陈山今晚八点和自己在心心咖啡馆见面。陈山回到家，余小晚提出让陈山晚上陪自己去跳舞，陈山想到晚上和荒木惟的见面，拒绝了余小晚。晚上，荒木惟以临江学院校董李元培的身份通过闸口后，检查身份的小兵曾经在临江学院当过教员，识破了荒木惟的身份，两人赶紧追了上去。千田英子见两人追得太紧，本想取消今晚和陈山的见面，荒木惟却让千田英子把自己送到军人俱乐部，并想办法通知陈山来找自己。
千田英子引开了追踪的两个小兵后，给心心咖啡馆打了电话，让陈山去军人俱乐部见荒木惟。军人俱乐部今晚正在举行联谊会，里面全部都是军统的人。陈山来到军人俱乐部，先和张离打了个招呼。另一边，千田英子也混入军人俱乐部，为荒木惟找到了一个可以谈话的包房。荒木惟示意陈山到吧台和自己谈话，两人暗中谈话时，被周海潮盯上，周海潮觉得荒木惟的形迹可疑，吩咐洪京军叫阿强跟着荒木惟，查清荒木惟的身份，千田英子在一旁看到了周海潮的动作。
陈山没有急于去和荒木惟会面，反而又和张离坐下，若无其事地聊天。另一边，阿强正拿着枪对准荒木惟审问他的身份时，千田英子及时出现，将阿强打倒在地。陈山来和荒木惟见面，洪京军带着人正想上楼查看情况，也被千田英子拖延。
谍战深海之惊蛰第8集 预告
余小晚觉得周海潮是在针对陈山，余小晚对周海潮一顿数落。不知不觉间，余小晚习惯了有陈山的存在，对陈山有了感情。
谍战深海之惊蛰第9集 预告
周海潮用激将法成功当着陈山的面让余小晚和自己跳舞，余小晚为了证明自己不受陈山的控制，便接受了周海潮的邀约。荒木惟知道有人盯上了自己，让陈山掩护自己离开。陈山正在吸引众人注意力时，洪京军依旧死盯着荒木惟，千田英子突然开枪，掩护荒木惟趁乱离开。
